侵华日军淮南罪证遗址位于安徽省淮南市大通区境内，包括万人坑、秘密水牢、窑神庙、站后碉堡、碉堡水牢、日军司令部、日军弹药库、日军地堡、日军南宿舍碉堡等九处遗址。现为第七批全国重点文物保护单位，编号为：7-1745-5-138。
图1：大通万人坑教育馆门券正面
万人坑，位于淮南市大通区舜耕山北麓、万人坑教育馆南部，为3个南北向长方形坑，每坑长20米、宽3米、深3米，坑与坑间距2.4米。自民国二十七年（1938年）夏建成至民国三十年（1941年）冬，被日军残害致死、食用日军发放的发霉麦麸病死的万余名矿工及矿工家属尸骨被日军投入其中，从而掩盖其罪行。
图2：大通万人坑教育馆门券背面
秘密水牢因位于采煤塌陷区，1968年淮南矿务局将秘密水牢由原大通煤矿南门内迁至万人坑教育馆外西北侧约200米处，利用原材料按原样复原。其面积为120平方米，高6.9米，灰砖转角瓦房，分地上（审讯室）、地下（水牢）两部分∶地上被一隔墙分为大致相等的两部分，每个部分都设有铁门，铁门旁另修1米见方的竖井，井口有铁板盖，以铁梯与地下水牢相连。先后有近百名抗暴矿工及新四军战士在秘密水牢内被迫害致死。
图2：窑神庙
窑神庙，位于居仁新村内，为砖木结构仿古建筑，坐北朝南，硬山顶，青砖灰瓦；总高6.9米，面阔3开间共12.55米、进深7.44米，穿梁式木构，重檐下有庑廊；正面开一门两窗，门窗上端用半圆形装饰成简单的日出图样，具有较明显的日式建筑风格。
站后碉堡，位于原大通火车站西50米，民国二十八年（1939年）日军修建，砖石水泥结构，圆筒状，上小下大，水泥抹面；高14.1米，底部直径6米，上下三层，三层顶有平台，有一周垛墙。每层设有枪眼、出气孔。层层由铁梯相连。底层墙厚度1米，底层正南有一铁门。站后碉堡是日军在大通地区修建的36座稠堡中最高的一座。
碉堡水牢，位于大通第一小学院内西北角，地上为一圆筒形石块结构建筑，高6.4米，直径7米，分上下二层，每层有4个枪眼，顶层有平台；地下是与碉堡等径的水牢，深2米。北、西两侧分别有一铁门。
日军司令部，为一四合院，房屋面积达1200多平方米。
日军南宿舍碉堡，是专为保卫日军及其家属而建。
